Systém řízení jakosti společnosti AVAPS s.r.o.byl v r.2000 certifikován podle ČSN EN ISO 9002:2000. Společnost byla jednou z prvních ve svém oboru, který tento certifikát obdržela.
Důvody které společnost k tomuto kroku vedly, byly nejen formální, ale především to byla snaha o vytvoření účinného, funkčního a efektivního systému jakosti, který by zaručoval, že naše výrobky a služby budou vyhovovat požadavkům zákazníka i požadavkům trhu.
V r.2003 byl systém řízení certifikován podle novelizované normy ČSN EN ISO 9001:2001 a je stále udržován a rozvíjen dle potřeb společnosti. Systém nám umožňuje sledovat průběh činností a jejich výsledky ve vztahu na účinnost, efektivnost a trvalé zlepšování. Vytváří podmínky pro vzájemně výhodné dodavatelsko-odběratelské vztahy s systematickou a preventivní činností nám zaručuje, že vzniklé neshody se již nebudou opakovat.